开始之前：先写下这次阅读要解决的问题
没有阅读问题时，PDF 批注很容易变成对版面的重复上色。打开文档之前，先用一句话写下本次阅读目标，例如判断一种方法是否适合当前项目，或找出作者用来支持结论的主要证据。
阅读目标不需要覆盖整本书或整篇论文。它只需要帮助你决定哪些内容值得标记，哪些内容可以略过。
- 概念型任务：弄清一个术语与相邻概念的区别；
- 证据型任务：确认某项结论由哪些数据或论证支持；
- 方法型任务：判断一套步骤的适用条件和限制；
- 对照型任务：比较多篇文献对同一问题的不同回答。
第一阶段：用文献库组织 PDF、EPUB 与阅读进度
多文档阅读的难点不是同时打开很多窗口，而是知道每份材料在当前问题里承担什么角色。可以按项目、主题或研究问题建立文件夹，并为每份材料记录正在阅读、等待核对或已经完成等状态。
PDF 和 EPUB 最好进入同一套文献整理规则。这样，电子书笔记、论文标注和后续复习不会因为文件格式不同而分散到几套系统里。
| 材料角色 | 阅读时关注什么 | 完成后留下什么 |
|---|---|---|
| 核心材料 | 主要论点、章节结构、关键定义 | 主题骨架与重要出处 |
| 证据材料 | 数据、案例、实验设计与限制 | 可核对的证据节点 |
| 对照材料 | 不同解释、冲突结果与适用条件 | 对比关系与待确认问题 |
| 参考材料 | 术语、背景和进一步阅读线索 | 索引与必要摘录 |
第二阶段：把 PDF 批注写成可再次使用的信息
精确标注的价值不在于颜色数量，而在于以后能否看懂当时的判断。高亮负责指出原文，批注负责说明为什么保留它。只复制句子而不记录判断，几周后通常还要重新阅读上下文。
每条 PDF 阅读笔记都应保留文档、页码、选区或图表区域。后续整理成脑图或卡片时，这些来源信息不能被复制操作切断。
| 标注类型 | 适合记录什么 | 批注示例 |
|---|---|---|
| 定义 | 概念的边界和必要条件 | 它与相邻概念的区别是什么？ |
| 关系 | 因果、对比、包含或先后顺序 | A 只在什么条件下导致 B？ |
| 证据 | 数据、引文、图表和实验结果 | 这项证据能支持到什么程度？ |
| 问题 | 疑点、冲突和需要继续查找的内容 | 另一份材料是否给出不同解释？ |
第三阶段：用思维导图连接标注，而不是重新抄写
PDF 思维导图不应只是章节目录的另一种画法。更有用的做法是围绕正在解决的问题，把来自不同页、不同文档的标注连接成定义、证据、反例和结论。
脑图节点最好继续引用原始标注。这样，移动节点、调整结构或建立笔记关系图时，不需要复制整段文字；需要核对时仍能跳回 PDF 原文。
- 先放入问题节点，再连接可能的回答；
- 把支持与反对证据分开，避免只收集同一方向的材料；
- 重复节点先合并，再决定是否值得长期保留；
- 无法连接到当前问题的摘录，暂时不要放进核心脑图。
第四阶段：把关键节点改写为主动回忆题
不是每条标注都需要制成记忆卡片。优先选择以后需要独立判断、解释或应用的内容，再把它改写成没有原文提示也能尝试回答的问题。
FSRS 和其他间隔重复方法负责安排再次出现的时间，主动回忆负责检验能否从记忆中提取答案。卡片仍应保留原文位置，答错或发现问题含糊时可以回到出处修改。
| 原始笔记 | 主动回忆题 | 为什么更有效 |
|---|---|---|
| 高亮一段定义 | 这个概念由哪两个必要条件组成？ | 要求提取结构，不是辨认原句 |
| 保存一张流程图 | 缺少提示时能否画出主要步骤？ | 检验关系和顺序 |
| 记录两种方法 | 在当前条件下应选择哪一种，为什么？ | 要求作出可核对的判断 |
第五阶段：明确本地保存、多端同步和备份边界
离线笔记软件解决的是没有网络时能否继续工作，本地知识库解决的是文件和索引由谁控制，多端同步解决的是设备之间如何交换变化。这三个问题相关，但不能混为一谈。
日常阅读可以把 PDF、标注、脑图和复习记录保存在设备上。同一局域网内可以直接传输，跨网络时可以使用自己的 WebDAV。同步完成后仍要保留独立备份，因为同步会复制正确修改，也会复制误删。
- 确认普通阅读是否需要默认上传原文；
- 确认同步包含哪些数据，冲突时如何处理；
- 至少保留一份不被实时同步覆盖的历史副本；
- 更换设备前，实际演练一次导出和恢复。
一份可以重复使用的阅读检查表
- 这次阅读是否有一个明确、可回答的问题？
- 每条重要批注是否记录了保留理由？
- 脑图节点是否仍能回到原文页码或选区？
- 复习题是否只检验一个核心判断？
- 多篇文献之间是否记录了支持、冲突和适用条件？
- 同步之外是否还有可以恢复的备份？
这条工作流如何落到 PropheNote
PropheNote 把 PDF、EPUB、标注、脑图与 FSRS 复习放在同一个本地知识工作台中。标注进入脑图和复习后继续保留原文位置；设备之间可以使用局域网直接同步，也可以连接自己的 WebDAV。
工具只能减少重复搬运，不能替代阅读时的判断。先用上面的检查表建立稳定流程，再根据材料类型调整标注、脑图和复习比例。